Podano prawdopodobną przyczynę nieudanego startu:
dezintegracja zbiornika ciekłego tlenu w trzecim stopniu RN została spowodowana awarią pompy utleniacza silnika RD-0110. Zniszczenie pompy zostało wywołane przez ewentualne dostanie się ciał obcych lub na skutek wady nabytej podczas produkcji silnika.
РОСКОСМОС. НАЗВАНЫ ВОЗМОЖНЫЕ ПРИЧИНЫ АВАРИИ ТГК «ПРОГРЕСС МС-04»
11.01.2017 18:27
Члены аварийной комиссии установили следующее: наиболее вероятная причина аварии – вскрытие бака «О» третьей ступени РН в результате воздействия элементов, возникших при разрушении двигателя 11Д55 вследствие возгорания и дальнейшего разрушения насоса окислителя. Причиной возгорания насоса окислителя могло стать возможное попадание посторонних частиц в полость насоса либо возможное нарушение технологии сборки двигателя 11Д55 (несоответствие зазоров между шнеком и втулкой; между плавающими кольцами и крыльчаткой, возможный дисбаланс и биение ротора). Дефект, имеющий производственный характер, проявился в полёте.
http://www.roscosmos.ru/23117/Engine-Related Failure likely cause of Soyuz U Mishap with Progress MS-04 January 11, 2017
December 1 loss of the Progress MS-04 cargo spacecraft was most likely caused by a failure within the Soyuz rocket’s upper stage engine which caused the third stage oxidizer tank to rupture. (...)
According to Roscosmos, the most probable cause of the accident was the disintegration of the third stage’s Liquid Oxygen tank as the result of the failure of the RD-0110 engine’s oxidizer pump. The destruction of the pump was triggered by a possible ingestion foreign objects or a defect introduced during production of the engine such as clearance between the pump shaft and its mounting sleeve, or unbalanced rotor components that could have caused excessive vibration which then transferred unusual loads into the oxidizer tank. (...)
http://spaceflight101.com/progress-ms-04-roscosmos-mishap-report/